优化的全幻灯片图像H&E污点规范化:迈向数字病理学大数据集成的一步
Jose L Agraz1, Carlos Agraz2, Andrew A Chen3
1Wilson Laboratory and Department of Pathology and Laboratory Medicine, Perelman School of MedicineUniversity of Pennsylvania Philadelphia PA 19104-4238 USA.
IEEE open journal of engineering in medicine and biology
|November 20, 2024
概括
本研究引入了数字病理学中污点颜色规范化 (SCN) 的数据驱动方法,显著提高了效率并减少了对参考全幻灯片图像 (WSI) 的需求. 这一进步提高了计算病理学分析的可靠性.
科学领域:
- 数字病理学和计算分析
- 医学诊断和疾病鉴定
- 生物医学图像处理 生物医学图像处理
背景情况:
- 病理学和组织学对于疾病诊断至关重要.
- 数字组织病理学和全片图像 (WSI) 能够有效分析活检数据.
- 在WSI分析中的批量偏差可能会影响诊断准确性.
研究的目的:
- 为WSIs开发一种高效的污点颜色规范化 (SCN) 方法.
- 为了减少数字遗传病理学中的批量偏差.
- 通过最大限度地减少对参考WSIs的依赖来优化SCN过程.
主要方法:
- 为SCN开发了一种数学,数据驱动的方法.
- 使用染色矢量 欧几里德距离分析用于颜色收.
- 通过距离分析,时间和定性/定量评估验证了该方法.
主要成果:
- 数据驱动的SCN方法显著提高了过程效率.
- 加快了50倍的颜色收分析.
- 减少了对参考WSIs的要求超过一半.
结论:
- 数据驱动的SCN方法提高了计算病理学的精度和可靠性.
- 这一进步有可能改善诊断过程和患者的治疗结果.
- 优化的SCN有助于实现更强大的数字遗传病理学工作流.
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