通过溶剂诱导的蛋白质沉和定量质谱法研究抗感染药物的向接触
Lorenzo Bizzarri1,2, Dominik Steinbrunn1,3, Thibaut Quennesson4
1OmicScouts GmbH, Lise-Meitner-Straße 30, Freising D-85354, Germany.
ACS infectious diseases
|November 20, 2024
概括
整体溶剂诱导蛋白沉 (iSPP) 快速评估药物向在病原体中的作用. 该方法通过有效识别与细菌标的化合物相互作用,加速对抗微生物耐药性 (AMR) 的早期药物发现.
科学领域:
- 生物化学 生化学
- 微生物学 微生物学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 抗菌素耐药性 (AMR) 是一个日益严重的全球卫生危机,由耐药性病原体的快速出现所驱动.
- 新抗微生物药物的开发速度缓慢,迫切需要创新的药物发现方法.
- 在药物开发管道的早期评估目标参与是至关重要的,但具有挑战性.
研究的目的:
- 引入和验证综合溶剂诱导蛋白沉 (iSPP) 作为评估药物标参与的快速方法.
- 应用iSPP来识别临床相关的抗微生物耐药病原体中的药物点.
- 为了证明iSPP在从基于目标的药物发现工作中评估化合物的实用性.
主要方法:
- 开发了一种针对细菌提取物的优化iSPP协议,最大限度地减少样本输入,完善变性梯度.
- 利用定量质谱法 (LC-MS/MS) 来分析对潜在药物化合物的反应中蛋白质稳定性的变化.
- 在四种关键的AMR病原体的细胞提取物上测试了iSPP方法: *大肠杆菌*, *肺炎菌*, * Pseudomonas aeruginosa* 和 *金黄色葡萄球菌*.
主要成果:
- 在四种测试的细菌物种中成功识别了七种不同药物的已知抗生素标.
- 对于5个小分子的被证明的目标参与,专门针对2-C-甲基-d-erythritol 4-phosphate (MEP) 途径中的酶.
- 在复杂的生物样本中验证了iSPP在识别化合物与其预期分子标之间的相互作用方面的有效性.
结论:
- iSPP是一种可适应和有效的方法,用于在早期抗微生物药物发现中快速评估目标参与.
- 该iSPP工作流程有助于识别抗感染药物标,解决打击AMR的一个关键瓶.
- 这种技术促进了对抗耐药性感染的新疗法的开发.
关键词:
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