使用后优化材料在结直肠癌中检测SDC2促剂甲基化的实验室间一致性
Lijing Zhang1,2,3, Duo Wang1,2,3, Ziqiang Li1,2,3
1National Center for Clinical Laboratories, Institute of Geriatric Medicine, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing Hospital/ National Center of Gerontology, Beijing, P.R. China.
iScience
|November 21, 2024
概括
在中国开发了一个新的外部质量评估 (EQA) 面板,用于便中Syndecan 2 (SDC2) 甲基化检测. 该工具提高了非侵入性结肠直肠癌 (CRC) 查测试的准确性.
科学领域:
- 分子诊断学 分子诊断
- 癌症生物标志物 癌症生物标志物
- 基因组医学是基因组医学.
背景情况:
- 基于便DNA的Syndecan 2 (SDC2) 甲基化检测是早期结直肠癌 (CRC) 查的一个有希望的非侵入性策略.
- 中国的商业SDC2甲基化试验具有可变的灵敏度和特异性,缺乏标准化的外部质量评估 (EQA).
研究的目的:
- 开发和验证用于SDC2甲基化检测的EQA小组,以确保CRC查的准确性.
- 为在中国使用的SDC2甲基化试验建立标准化质量控制.
主要方法:
- 利用CRISPR-Cas9和同质导向修复 (HDR) 来创建超甲基化和异质的SDC2促进细胞系.
- 开发了一个10个样本的EQA小组,具有不同的甲基化水平.
- 进行了一项EQA研究,涉及140个实验室和1400个测试结果.
主要成果:
- 开发的EQA小组有效监测了SDC2甲基化检测的准确性.
- 一项涉及140个实验室的EQA研究显示,在1400个结果中,错误率很低,为0.57%.
- EQA材料证明了其确保可靠和一致的临床测试的能力.
结论:
- 优化的EQA材料在监测SDC2甲基化检测CRC的精度方面是有效的.
- 该EQA计划支持可靠的临床测试,为中国的早期CRC查和诊断做出贡献.
