在全细胞尖端安普利康序列测定中验证的挑战,以全面量化食品乳酸细菌的数量
Mugihito Oshiro1, Keisuke Nakamura1, Yukihiro Tashiro1
1Laboratory of Soil and Environmental Microbiology, Division of Systems Bioengineering, Department of Bioscience and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Graduate School, Kyushu University, Fukuoka, Japan.
Bioscience, biotechnology, and biochemistry
|November 21, 2024
概括
精确量化发酵食品中的乳酸细菌 (LAB) 是非常重要的. 使用内部标准进行细胞尖端安普利康序列测定,提供了一种全面的方法来准确测量LAB微生物组结构.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 食品科学 食品科学 食品科学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 乳酸细菌 (LAB) 是发酵食品微生物组的关键组成部分.
- 了解LAB社区结构对于食品质量和安全至关重要.
- 目前的量化方法可能缺乏全面性和准确性.
研究的目的:
- 为了验证细胞尖端的安普利康序列,以准确量化食品LAB社区.
- 评估使用尖端外源细菌细胞作为内部标准的可靠性.
- 为了建立微生物组分析的定量关系.
主要方法:
- 使用了16S rRNA基因扩增序列测序.
- 外源性细菌细胞作为内部标准被增加.
- 使用15种LAB模拟社区开发了定量方程.
主要成果:
- 细胞入测序表明了全面和准确的LAB量化潜力.
- 在读数和预期的16S rRNA基因拷贝数 (R2 ≥ 0.6823) 之间观察到正相关性.
- 观察到的与预期的副本数量差异在1/3到3倍的范围内.
结论:
- 细胞尖端安普利康序列是量化食品LAB的验证方法.
- 通过内部标准来弥补DNA提取效率低下至关重要.
- 准确准备模拟社区对于可靠的结果至关重要.
