使用分子条形码精确的血统追踪证明了适应性对虫虫中对伊弗米克耐药性的权衡
Zachary C Stevenson1, Eleanor Laufer1, Annette O Estevez1
1Institute of Ecology and Evolution, University of Oregon, Eugene, OR 97401, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|November 22, 2024
概括
这项研究引入了一种新的动物模型,用于实验进化,使用条形码的Caenorhabditis elegans来测量自然选择. 它揭示了对ivermectin耐药性的权衡,低度药物的成本和更高水平的益处.
科学领域:
- 进化遗传学的进化遗传学
- 动物模型系统动物模型系统
- 实验进化的实验进化.
背景情况:
- 环境的变化影响了基因的选择.
- 条形码谱系追踪对于测量微生物实验进化的选择是有效的.
- 在动物中随机基因组条形码的整合是具有挑战性的,因为生殖线的保护.
研究的目的:
- 开发第一个随机插入的基因组条形码实验进化动物模型,使用Caenorhabditis elegans.
- 精确测量C. elegans种群中对ivermectin耐药性的选择强度.
- 为了研究与ivermectin耐药性相关的权衡.
主要方法:
- 在Caenorhabditis elegans中使用了TARDIS条形码系统.
- 创建了一个实验进化模型,随机插入基因组条形码.
- 在液体培养中多种多样的ivermectin度来控制选择强度.
- 随着时间的推移,使用深度测序来估计血统适应性的量化条形码频率.
主要成果:
- 在低度药物中显示出对ivermectin耐药性的高成本.
- 观察到,当ivermectin度超过2nM时,耐药性变得有利.
- 确定了可能由于抵抗性个体的发展速度受阻而导致的权衡.
结论:
- 在实验进化中,Caenorhabditis elegans作为高通量健身估计的强大模型.
- 这种条形码方法为研究进化和经济重要特征提供了高精度的适应性估计.
- 该研究强调了选择力对特定遗传特征的环境依赖.


