GoFCards:一个集成的数据库和分析平台,用于获取人类的功能变体
Wenjing Zhao1,2,3, Youfu Tao4, Jiayi Xiong1
1National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Department of Geriatrics, Xiangya Hospital & Center for Medical Genetics, School of Life Sciences, Central South University, No. 87 Xiangya Road, Furong District, Changsha, Hunan 410008, China.
识别功能增益 (GOF) 变体对于疾病研究至关重要. GoFCards是一个新的数据库,简化了研究人员和临床医生对这些关键遗传变异的访问和分析.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 功能增益 (GOF) 变体改变蛋白质功能,在疾病机制中发挥关键作用.
- 鉴定和分析致病性GOF变体是具有挑战性的,因为数据碎片化和数据库限制.
- 获取GOF变种的关键遗传信息需要有效的工具.
研究的目的:
- 开发一个全面的数据库,以访问和分析人类GOF变体.
- 为遗传学家和临床医生提供一个用户友好的平台来解释GOF变异.
- 通过简化GOF变种识别和优先级的过程来促进遗传研究.
主要方法:
- 手册文献审查以确定3089个单核酸变体和72个插入/删除在579个与1299种疾病相关的基因.
- 识别的变种与350万预测的GOF变种的整合.
- 开发一个专有评分系统,以根据证据和预测得分来优先考虑GOF变体.
- 创建了GoFCards数据库 (http://www.genemed.tech/gofcards),其中包含来自150多个来源的数据.
主要成果:
- 确定了3089个单核酸变体和72个插入/删除在579个与1299种疾病相关的基因中.
- 集成手动策划和预测的GOF变体,创建一个全面的数据集.
- 开发了GoFCards,这是一个数据库,提供来自150多个来源的变异级和基因级注释.
- 实施了分数系统,以优先考虑GOF变体和帮助他们的解释.
结论:
- GoFCards为遗传学家和临床医生提供了一个高效和易于访问的平台,以获取和分析人类GOF变体.
- 该数据库简化了GOF变体的解释,赋予了有限生物信息技能的用户权力.
- GoFCards旨在通过改善对关键GOF变异信息的获取和理解来推进遗传研究.
更多相关视频
09:34Targeted Next-generation Sequencing and Bioinformatics Pipeline to Evaluate Genetic Determinants of Constitutional Disease
Published on: April 4, 2018
11:35Screening for Functional Non-coding Genetic Variants Using Electrophoretic Mobility Shift Assay EMSA and DNA-affinity Precipitation Assay DAPA
Published on: August 21, 2016
相关概念视频
Genomics
Single Nucleotide Polymorphisms-SNPs
Human Genetics
The complex relationship between genetics and psychology is observable through common biological components such...
Genetic Screens
Forward genetic screens
Forward or “classical” genetic screens involve creating random mutations in an organism’s DNA using radiation, mutagens, or insertion of additional bases, which...
Genome-wide Association Studies-GWAS
GWAS does not require the identification of the target gene involved in...
In-vitro Mutagenesis
