酵母基因组在活细胞中可以在全球范围内获取
Hemant K Prajapati1, Peter R Eriksson1, Paul A Elizalde1,2
1Division of Developmental Biology, Eunice Kennedy-Shriver National Institute of Child Health and Human Development, National Institutes of Health, Bethesda, MD, USA.
Nature structural & molecular biology
|November 25, 2024
概括
活的酵母细胞表现出全球可访问的基因组,与孤立的核中的受限制可访问性不同. 由ATP依赖的重塑剂驱动的染色体动力学表明,动态DNA包装通常不是压制性的.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 细胞基因组被包装成染色质,这种结构挑战了蛋白质的获取.
- 对于基因调节来说,DNA的可访问性至关重要.
- 在体内了解色素动态对于破译基因表达控制至关重要.
研究的目的:
- 为了测量在活的芽酵母细胞中全基因组的DNA可访问性.
- 为了比较体内与隔离核中的DNA可访问性.
- 为了研究染色体重塑剂在核细胞动力学中的作用.
主要方法:
- 在活的酵母细胞中诱导DNA甲基转移酶的表达.
- 全基因组测量DNA可访问性的测量.
- 消耗了依赖ATP的染色体重塑剂.
主要成果:
- 在活的酵母细胞中,基因组是全球可访问的,与孤立的核中的受限制可访问性形成鲜明对比.
- 酵母染色素在体内具有高度动态性,基因体具有与促进体相似的可访问性.
- 沉默的位置和中间体受到保护,而核细胞的位置在染色体重塑剂耗尽后会发生变化.
结论:
- 染色质在活细胞中存在于不断流动的状态,但在孤立的细胞核中是静态的.
- 核动力学很可能是由ATP依赖的染色体重塑剂的竞争作用驱动的.
- 酵母中的DNA包装在活细胞中通常不是压制性的.
