转录基因和表观基因特征区分肝脏瘤发展的高风险和低风险内型
Sandra L Grimm1,2,3, Tia Talley3, Rahul K Jangid3
1Department of Molecular and Cell Biology, Baylor College of Medicine, Houston, Texas, USA.
Environmental and molecular mutagenesis
|November 26, 2024
概括
早期暴露于内分泌干扰化学物质,如微丁 (TBT),可以改变表观基因组,增加肝脏瘤的风险. 肝脏中的这些表观遗传和转录基因变化在小鼠的瘤发育之前发生.
科学领域:
- 环境表观遗传学环境表观遗传学
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- 表观基因组调解环境对健康的影响,有助于疾病易感度的个体差异.
- 干扰内分泌的化学物质 (EDCs),如tributyltin (TBT),可以影响发育过程和长期健康结果.
- 暴露于TBT的小鼠中的肝瘤发育因性别,饮食和时间而异,表明复杂的相互作用.
研究的目的:
- 为了调查与肝脏瘤发育相关的转录和表观基因组变化,后发展暴露于TBT.
- 在暴露于TBT的小鼠中识别瘤风险的早期生物标志物.
主要方法:
- 基因相同的C57Bl/6小鼠从怀孕到断奶期间暴露在TBT中.
- 从高风险 (瘤发育) 和低风险 (没有瘤) 暴露于TBT的小鼠的血液和肝脏组织的转录基因 (RNA-seq) 和表观基因 (ChIP-seq) 分析.
- 对不同时间点的组织样本进行分析,以确定瘤前变化.
主要成果:
- 血液转录组资料区分了暴露于TBT的对照小鼠,但没有高风险的低风险小鼠.
- 高风险小鼠的肝脏组织与低风险小鼠相比显示出明显的转录和表观基因特征,与瘤有共同特征.
- 这些高风险的肝脏特征在小鼠中早在5个月时就被检测出来,这是在瘤表现之前.
结论:
- 发育期的TBT暴露不足以引起肝脏瘤发生,表现出可变的透率.
- 结核病治疗暴露引起的肝脏的表观基因和转录基因重编程与肝脏瘤发展的风险增加有关.
- 早期发现特定的肝脏分子特征可能表明TBT诱导的肝癌风险增加.
