AQSA-微流体设备中癌细胞衍生的球体的自动量化算法

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 生物信息学是一种生物信息学.
• 癌症研究 癌症研究

背景情况:

• 癌症干细胞 (CSCs) 在化学抵抗和复发中至关重要.
• 球形形成试验丰富了CSCs,但手动计数是费力和主观的.
• 为了可靠地预测化疗试验,需要自动化量化.

研究的目的:

• 开发和验证一个自动计算程序,即自动量化球体算法 (ASQA),用于检测,计数和测量CSC球体.
• 将ASQA的性能与手动计数和现有软件 (SpheroidJ) 进行比较.
• 评估ASQA在观察治疗反应方面的实用性及其在资源有限的环境中的适用性.

主要方法:

• 开发了自动量化球体算法 (ASQA).
• 将ASQA计数与手动计数进行比较 (p = 0.167).
• 对单个球体的ASQA面积测量与SpheroidJ进行比较 (p = 0.173).
• 评估ASQA绩效与统一和非统一的背景.
• 在LN229细胞系和初级培养CSC上测试ASQA.

主要成果:

• 与手动计数相比,ASQA没有显示出统计学上显著的差异.
• 在面积测量方面,ASQA表现出高精度,与SpheroidJ.
• 该算法有效地检测和量化多个领域,使得治疗反应观察.
• 在具有统一背景的情况下,ASQA有效地运行;不统一可能会引入文物.
• 该算法以较低的计算成本快速处理图像 (0.3s/image).

结论:

• ASQA提供了一种自动化,准确和高效的CSC球量化方法.
• 该算法可以适应细胞系和初级培养.
• ASQA的可访问性和速度可以使全球癌症研究受益,有助于开发更好的化疗策略.
• 自动 CSC 检测可以帮助避免无效的治疗,并减少患者的毒性.