与子枯病相关的植物质体的表征及其敏感诊断方法
Natesan Boopathi1, Gandhi Karthikeyan1, Muthurajan Raveendran2
1Department of Plant Pathology, Tamil Nadu Agricultural University, Coimbatore, India.
Journal of microbiological methods
|November 26, 2024
概括
一种新的植物等离子体疾病正在南印度摧毁子棕树,造成严重的经济损失. 研究人员开发了一种快速循环介导同热放大 (LAMP) 测试,用于早期检测和管理这种子病.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子诊断学 分子诊断
- 农业昆虫学 农业昆虫学
背景情况:
- 由植物质体引起的子,对印度南部的子种植园构成严重威胁,导致棕树的快速破坏和经济困难.
- 在Thanjavur和Coimbatore地区记录了高达2.5%的疾病发病率,其独特的症状与已知的根病不同.
研究的目的:
- 为了确定负责观察到的子枯病的植物质.
- 开发一种快速,灵敏和特定的诊断方法,用于早期发现和管理疾病.
主要方法:
- 使用嵌套PCR和多位点表征 (tuf和rp基因) 确认了植物质的存在.
- 用16S rRNA基因测序进行了家族遗传学鉴定,将病原体分配到"候选植物质星体".
- 针对16S rRNA基因的循环介导同热放大 (LAMP) 和实时LAMP测定被开发用于快速检测.
主要成果:
- 这种子枯植物质被确定为"Candidatus Phytoplasma asteris".
- 开发的LAMP试验证明了快速和特定的检测,通过颜色变化 (紫色到蓝色) 和梯子状的带来指示.
- 实时LAMP提供了进一步的确认,病变样本的独特火峰为87±0.5°C.
结论:
- 已建立的LAMP协议提供了一种快速而灵敏的方法,用于检测可疑的子棕中的植物质.
- 这种诊断工具可以帮助控制子枯的传播,并选无疾病的种植材料.
