在肠道重塑过程中TRα和TRβ的补充和添加功能,由ChIP-Seq对野生类型和TR绝杀动物的分析揭示出来
Yuta Tanizaki1, Hongen Zhang2, Yun-Bo Shi3
1Section on Molecular Morphogenesis, Cell Regulation and Development Affinity Group, Division of Molecular and Cellular Biology, Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development (NICHD), National Institutes of Health (NIH), Bethesda, MD, USA; Department of Life Sciences, Graduate School of Arts and Sciences, The University of Tokyo, Meguro-ku, Tokyo, Japan.
甲状腺激素受体TRα和TRβ调节肠道发育. 在Xenopus tropicalis的前变形过程中,TRα在结合目标基因方面起到比TRβ更大的作用.
科学领域:
- 发展生物学 发展生物学
- 内分泌学 在内分泌学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 胚胎后发育涉及显著的肠道重塑,对哺乳动物发育至关重要.
- 甲状腺激素 (T3) 和它的受体 (TRα和TRβ) 是安变异的关键调节者.
- 热带的变形为研究人类胚胎后发育提供了一个模型.
研究的目的:
- 在肠道重塑过程中识别甲状腺激素受体 (TR) 结合基因.
- 确定TRα和TRβ对向基因结合的独特贡献.
- 在发育中的肠道中研究TR表达模式.
主要方法:
- 在Xenopus tropicalis变形过程中检查了TRα和TRβmRNA定位.
- 在野生型和TR-knockout子中利用染色体免疫沉降测序 (ChIP-seq).
- 分析了TR与T3治疗或不治疗的目标基因的结合.
主要成果:
- TRα表现出宽肠表达,而TRβ在高潮期间上调.
- TRα和TRβ都在包括干细胞在内的各种细胞类型中共同表达.
- 个别的TR淘汰会减少TR结合基因和结合程度,而TRα淘汰会产生更大的影响.
结论:
- TRα和TRβ都对肠道中的基因结合有贡献.
- TRα在前变态肠道中对基因结合的贡献更大.
- 这些发现阐明了TR亚型在发育基因调节中的作用.
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