新型差异表达的LncRNAs调节Artemisia annua中的艺术素生物合成
Tingyu Ma1, Tianyuan Zhang2, Jingyuan Song1
1Key Lab of Chinese Medicine Resources Conservation, State Administration of Traditional Chinese Medicine of the People's Republic of China, Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China.
长非编码RNAs (lncRNAs) 调节了Artemisia annua.中的素素的产生. 新的lncRNAs被确定并与关键的生物合成基因联系起来,为提高艺术素产量提供了洞察力.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 长非编码RNAs (lncRNAs) 在植物的二次代谢物生产中发挥调节作用.
- 在Artemisia annua中,lncRNAs在艺术素 (ART) 生物合成中的特定参与尚未得到充分理解.
- 素是一种重要的抗疟疾化合物,来源于A. annua.
研究的目的:
- 研究 lncRNAs 在 A. annua. 中调节美素生物合成中的作用.
- 为了确定新型的lncRNA和在高胺素产生 (HAP) 和低胺素产生 (LAP) 基因型之间差异表达的lncRNA.
- 为了建立 lncRNAs 和关键的艺术素素生物合成基因之间的相关性.
主要方法:
- 在HAP和LAP A. annua基因型上进行了RNA深度测序.
- 一个严格的生物信息学管道被用于识别新型和差异表达的lncRNAs.
- 进行了lncRNA表达和艺术胺素生物合成基因表达之间的相关性分析.
主要成果:
- 确定了1419种新的lncRNA,其中256种在HAP和LAP基因型之间表达不同.
- 发现三种lncRNAs (MSTRG.33718.2,MSTRG.30396.1,MSTRG.2697.4) 与关键的美素生物合成基因 (ADS,DXS,HMGS) 相相关.
- 这些lncRNAs的上调正调节了基因,可能增加了素生物合成,而在HAP基因型中,一个竞争性通路基因 (BAS) 被下调.
结论:
- 这项研究确定了IncRNAs,它们可能会在A. annua.中调节艺术素生物合成.
- 这些发现提供了对控制素生产的复杂监管网络的见解.
- 这些结果可以促进代谢工程策略,以提高素产量和可持续生产.
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