单细胞分析显示,单细胞基因表达特征影响了急性治疗队列中的HIV-1储库大小

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 病毒学 病毒学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 潜伏的HIV-1存储库是治愈艾滋病的主要障碍.
• 在抗逆转录病毒疗法 (ART) 期间影响储大小的宿主因素尚不清楚.
• 识别这些因素对于制定消除潜伏HIV的策略至关重要.

研究的目的:

• 调查宿主基因表达差异是否在抑制性ART期间调节HIV-1储库大小.
• 识别特定的宿主基因和与较小的HIV-1储库相关的细胞通路.

主要方法:

• 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 来自在急性感染期间启动ART的个体的外周血液单核细胞 (PBMC).
• 不同基因表达分析和通路丰富.
• 在独立的队列和完整的前病毒DNA测定 (IPDA®) 中验证.
• 功能细胞培养试验评估IL1B对HIV复制和潜伏的影响.

主要成果:

• 单细胞活性增加和单细胞中的IL1B表达与无法检测到的HIV-1储存器有关.
• IL1B表达与HIV-1储库大小相反相关,在单独的队列中得到验证.
• 单细胞IL1B显示出与储库大小的反向关联,可能由中央记忆CD4+T细胞介导.
• IL1B激活NF-κB,促进HIV-1感染,但抑制病毒传播,表明延迟逆转效应.

结论:

• 无偏见的scRNA-seq确定了单细胞IL1B变异作为在急性感染期间开始ART的个体中减少HIV-1前病毒储存的潜在因素.
• IL1B可能具有自然的潜伏逆转活性,有助于消耗艾滋病毒储存库.
• 这些发现强调了宿主免疫反应在控制HIV持续性方面的作用.