全基因组DNA甲基化标记与代谢性肝癌相关
Samuel O Antwi1,2, Ampem Darko Jnr Siaw1, Sebastian M Armasu3
1Division of Epidemiology, Department of Quantitative Health Sciences, Mayo Clinic, Jacksonville, FL, USA.
medRxiv : the preprint server for health sciences
|November 28, 2024
概括
血液中55个DNA甲基化标记的小组可以区分代谢性肝细胞癌 (HCC) 和良性肝病. 这种血液测试显示了早期检测代谢性HCC的前景.
科学领域:
- 肝病学 肝病学是一种肝病学.
- 在瘤学瘤学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 代谢性肝病是全球肝细胞癌 (HCC) 的快速增长原因之一.
- 将代谢功能障碍与HCC发育联系起来的分子机制在很大程度上是未知的.
研究的目的:
- 调查异常DNA甲基化在代谢性HCC的发展中的作用.
- 识别基于血液的DNA甲基化标记物,用于检测代谢性HCC.
主要方法:
- 一项多中心的国际病例控制研究,涉及272名代谢性HCC患者和316名对照.
- 使用850k EPIC阵列,对外围血液白细胞的全基因组DNA甲基化概况.
- 对细胞类型比例进行调整的差异甲基化分析,结果在单独的队列中得到验证.
主要成果:
- 与对照组相比,在代谢性HCC患者中发现了55个差异甲基化的CpG位点 (33个高甲基化,22个低甲基化).
- 这些55个CpG的分类器小组显示出良好的诊断性能 (AUC=0.79).
- 将55个CPG与临床因素 (年龄,性别,种族,糖尿病) 结合起来,进一步提高了诊断准确度 (AUC=0.78).
结论:
- 一个由55个血液DNA甲基化标记物组成的小组有效地区分了代谢性HCC与良性代谢性肝病.
- 当将甲基化数据与人口统计和临床信息相结合时,诊断性能会得到提高.
- 这些发现表明,一种基于血液的生物标志物有可能用于代谢性HCC检测.
