在16S微生物组分析过程中,从女性的子宫和子宫内膜样本中检测到避免诊断的Chlamydia trachomatis变体
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|November 28, 2024
概括
在2019年之前,一种避开探针的克拉米迪亚形虫 (CT) 突变在美国流传. 这一发现凸显了如果初始核酸放大试验对CT呈阴性结果,则需要进行替代测试.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 分子诊断学 分子诊断
背景情况:
- 在220名参与者的宫性阴道微生物组的16SrRNA分析显示,通过Aptima Combo2测定,样本中的克拉米迪亚虫 (CT) DNA呈阴性.
- 同样通过同样的测定方法,在对NG感染负的样本中也检测到菌 (NG) DNA.
研究的目的:
- 调查16S rRNA测序与CT和NG感染标准诊断试验之间的差异.
- 在CT检测中描述虚假阴性结果的遗传基础.
主要方法:
- 针对性PCR放大和测序克拉米迪亚23SrRNA的位置.
- 定量PCR (qPCR) 用于检测残留样本中的炎球菌DNA.
- 使用16S rRNA测序对宫和阴道微生物组的分析.
主要成果:
- 不一致的样本中的克拉米迪亚DNA含有23SrRNA位点中的G1526A变体,这是已知的探针避开突变.
- 菌DNA检测与接近诊断试验检测极限的低水平感染一致.
- 探针避开CT变种在美国东北部流传,在其被记录的特征化之前.
结论:
- 该研究确定了在美国流通的避探型CT突变,解释了假阴性NAAT结果.
- 临床医生应该考虑重复测试与替代目标持续的症状或已知的暴露,如果初始NAAT是负的.
- 这凸显了持续监测逃避诊断的微生物变异的重要性.


