单细胞转录组学揭示了肝细胞中过度激活的活性氧物种通路,用于肝细胞癌的发展
Xiaoping Wang1, Penghui Li2, Huicong Ji3
1Department of Infectious Disease, The First Affiliated Hospital of Zhengzhou University, Zhengzhou, 450052, China. wangxp19731230@163.com.
反应性氧物种 (ROS) 途径在肝细胞癌 (HCC) 肝细胞中过度活跃,与预后不佳相关. 向ROS和JUND可能为HCC提供新的精密治疗方法.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 是全球癌症死亡的主要原因,其特点是瘤异质性显著.
- 活性氧物种 (ROS) 在HCC病变发生中的特定作用仍然未被充分探索.
研究的目的:
- 通过单细胞RNA测序来研究ROS在HCC发展中的作用.
- 确定分子机制和细胞相互作用驱动与ROS相关的HCC进展.
主要方法:
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 用Seurat和CellMarker对HCC和相邻组织进行分析.
- 使用DAVID和MsigDB进行路径分析,使用SCENIC进行转录因子网络映射,使用CellChat进行蜂通信分析.
- 根据ROS通路活性确定细胞亚群和肝细胞的亚分组.
主要成果:
- 确定了六个主要的细胞亚群,肝细胞是癌症和正常组织中最丰富的.
- 在HCC肝细胞中,ROS途径被显著激活,与能量代谢途径正相关.
- 呈现最高ROS活性的GPX4+肝细胞与更糟糕的HCC预后有关,JUND被确定为关键的调节因素.
- 发现GPX4+肝细胞和免疫细胞 (T细胞,M2巨细胞) 之间的相互作用促进HCC恶性病变.
结论:
- 在HCC肝细胞中,ROS途径被异常激活,导致疾病进展.
- 具有高ROS活性的GPX4+肝细胞与免疫细胞相互作用,促进HCC的发展.
- 推基于ROS途径和JUND开发分子亚型和风险评分,用于精确的HCC治疗.
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