由于一种新型序列类型的抗卡巴胺抗性Acinetobacter seifertii的新型序列类型引起的鼻病爆发
Patricia Orlandi Barth1, Dariane Castro Pereira2, Gabriela Simões de Oliveira3
1Laboratório de Pesquisa em Resistência Bacteriana, Hospital de Clínicas de Porto Alegre, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; Programa de Pós-Graduação em Ciências Médicas, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil.
一种新型的抗卡巴胺抗性Acinetobacter seifertii菌株ST2712,携带blaNDM-1基因,导致新生儿重症监护室爆发疫情. 基因组监测发现了这种新兴的病原体,这对于控制其传播至关重要.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- Acinetobacter seifertii是A. baumannii-calcoaceticus复合体的一部分,由于抗生素耐药性基因,人们越来越担心.
- 耐卡巴胺的A. seifertii构成重大威胁,特别是在像新生儿这样的脆弱人群中.
研究的目的:
- 在新生儿重症监护病房 (NICU) 调查抗卡巴因的A. seifertii疫情.
- 鉴定参与疫情的抗卡巴胺A. seifertii菌株的遗传基础和流行病学特征.
主要方法:
- 实时定量PCR (qPCR) 检测卡巴酶基因.
- 使用Illumina MiSeq和纳米孔MinION平台进行全基因组测序 (WGS).
- 福里埃变换红外光谱 (IR生物型) 用于微生物菌株的类型化.
主要成果:
- 十一名新生儿受到抗卡巴奈姆的A. seifertii.感染.
- 所有分离物都携带了blaNDM-1基因,并被确定为一种新型序列类型,ST2712.
- blaNDM-1基因位于所有分离物中相同的等离子体类型上,这表明克隆传播.
结论:
- 一种携带blaNDM-1的抗卡巴尼姆抗性A. seifertii (ST2712) 的新型菌株被确定为NICU疫情的原因.
- 这一发现突显了医疗保健环境中这种特定耐药菌株的出现.
- 使用WGS的基因组监测对于理解和管理抗卡巴烯姆A. baumannii复杂生物体的爆发至关重要.
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