全基因组关联分析识别了跨祖先的与年龄相关的黄斑变性不同的遗传架构

科学领域:

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• 遗传学 是一个遗传学.
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背景情况:

• 与年龄相关的黄斑变性 (AMD) 是全球不可逆转的视力丧失的主要原因.
• 在不同的人群中,尤其是非洲人和西班牙裔/拉丁裔祖先的人群中,对AMD的遗传风险因素尚不清楚.
• 这种知识差距阻碍了制定有效的,全球适用的预防和治疗策略.

研究的目的:

• 为AMD进行第一个多祖先全基因组关联研究 (GWAS).
• 在不同祖先群体中识别与AMD风险相关的新型遗传位置.
• 在已知的AMD风险位点调查祖先特有的遗传异质性.

主要方法:

• 结合了来自百万退伍军人计划和五个额外队伍的大规模GWAS的数据.
• 利用全基因组关联分析来识别与AMD相关的遗传位置.
• 在混合个体中进行了本地祖先解卷,以剖析单元型水平的影响.

主要成果:

• 发现了63个与AMD相关的遗传位置,其中30个是新鲜的.
• 在AMD风险位点中观察到显著的交叉祖先异质性,特别是在非洲祖先种群中.
• 在主要基因相容性复合体II类单双型中确定了主要信号,并在非洲祖先中降低了CFH和ARMS2/HTRA1位点的风险.
• 在非洲祖先的平分类型上发现了CFH风险等位基因的较小效应大小.

结论:

• 扩大AMD遗传研究以包括多样化的种群对于全面了解其架构至关重要.
• 对于AMD的遗传风险在不同的祖先之间有很大的差异,需要量身定制的方法.
• 发现了新的基因和途径,这些基因和途径以祖先依赖的方式为AMD风险做出贡献,为未来的治疗提供了潜在的标.