在头癌中检测cfHPV-DNA的方法:系统性审查和元分析
Jerin Thomas1,2, Eden Mazzara1,2, Meytal Guller1,2
1Institute of Molecular Medicine, The Feinstein Institutes for Medical Research, Manhasset, New York, USA.
概括
数字滴滴聚合酶连锁反应 (ddPCR) 和下一代测序 (NGS) 显示在头癌中检测人类乳头瘤病毒 (HPV) DNA 的高精度. ddPCR可能是查的成本效益,而NGS可能有助于疾病监测.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子诊断学 分子诊断学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 头部和部状细胞癌 (HNSCC) 经常与人类乳头瘤病毒 (HPV) 相关.
- 准确检测无细胞HPVDNA对于诊断和监测HPV相关的HNSCC至关重要.
- 为检测HPVDNA存在各种分子方法,每种方法都有不同的性能特征.
研究的目的:
- 为了比较不同方法的诊断准确性,以检测HPV无细胞DNA在HPV相关的HNSCC.
- 在这种情况下,评估数字滴滴聚合酶链反应 (ddPCR) 和下一代测序 (NGS) 等技术的实用性.
主要方法:
- 在PubMed,Embase和Scopes进行了系统的文献搜索.
- 分析了33项研究的数据,使用了两种方法,包括总结接收器运行特征曲线.
- 使用迪克的道图和QUADAS-2工具来评估Bias.
主要成果:
- 数字滴滴聚合酶连锁反应 (ddPCR) 显示出最高的诊断概率比率 (138),其次是下一代测序 (NGS) (120).
- 聚合酶链反应 (PCR) 和定量PCR显示出较低的诊断概率比率 (分别为31.4和8.74).
- 无论是ddPCR还是NGS都表现出HPVDNA检测的高诊断准确度.
结论:
- 在HNSCC中,NGS和ddPCR在HPVDNA的诊断准确度上是可比的.
- ddPCR为临床诊断和查提供了一个具有成本效益的选择,因为它的灵敏度很高,假阳性率很低.
- 由于其灵敏度和伴随性指标,NGS可能更适合用于疾病监测;建议进一步标准化和对基于唾液的测试进行调查.
