采用多孔板方法,在组织清除过程中增加样品吞吐量
Fumito Akiyama1,2, Katsuhiko Matsumoto1,3, Katsunari Yamashita1,4
1Laboratory for Synthetic Biology, Center for Biosystems Dynamics Research, RIKEN, Suita, Japan.
Nature protocols
|December 3, 2024
概括
这项研究介绍了一种用于3D病理学的高通量方法,该方法使用在六井板中并行清除组织. 这种方法简化了样本处理,减少了生物医学诊断和研究的实践时间.
科学领域:
- 生物医学诊断 生物医学诊断
- 病理学 病理学 病理学
- 细胞生物学 细胞生物学
背景情况:
- 传统的二维病理学限制了数据质量.
- 目前的3D组织清除工作流程复杂且耗时.
- 对于先进的生物医学诊断,需要增加吞吐量.
研究的目的:
- 开发一种高通量并行处理方法,用于3D组织清除和分析.
- 为了减少动手时间,提高3D病理学工作流程的效率.
- 适应现有的清算协议,以实现多样本兼容性.
主要方法:
- 一种新的工作流程,将组织清理设备与六井多井板相结合,用于并行处理.
- 集成被动清除方法,如清晰,无障碍的大脑/身体成像尾酒和计算 (CUBIC) 分析.
- 精简的凝嵌入,高速光片显微镜,以及在多井板格式内的基于云的数据分析.
主要成果:
- 实现了并行组织清除,免疫染色,成像和分析,增加了3D病理学吞吐量.
- 减少了每个样本的整体实践时间,尽管单个样本处理时间略有增加.
- 证明成功的全器官分析,在10天内完成清除,成像和数据分析,对一些样品.
结论:
- 开发的基于六井板的并行处理方法显著提高了3D病理学的吞吐量.
- 这种方法为细胞生物学和病理学研究提供了一个实用和高效的平台.
- 精简的工作流便于先进的生物医学诊断和数据采集.


