在大动脉剖析中与氧化应激相关的生物标志物的鉴定,基于批量转录组分析

科学领域:

• 心血管研究研究心血管研究
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 遗传学 是一个

背景情况:

• 大动脉解剖 (AD) 是一种危及生命的疾病.
• 阿尔茨海默病背后的分子机制,特别是氧化应激 (OS) 的作用,需要进一步阐明.

研究的目的:

• 研究大动脉剖析 (AD) 中氧化应激 (OS) 的分子机制.
• 为了确定新的与OS相关的生物标志物用于AD诊断和治疗.

主要方法:

• 利用基因表达总 (GEO) 和GeneCards数据库用于AD和OS相关的基因.
• 进行了差异表达分析,加权基因相关性网络分析 (WGCNA) 和蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络构建.
• 采用机器学习来识别特征基因,随后进行全面的生物信息学分析和临床模型建立,通过外部数据集,体外实验和门德尔随机化 (MR) 进行验证.

主要成果:

• 在AD中确定了六个与OS相关的特征基因:CCL2,ITGB4,MYC,SOCS3,SPP1和TEK.
• 开发的临床预测模型显示了令人满意的诊断疗效 (AUC > 0.75).
• CCL2,MYC,SPP1和TEK在外部数据集和体外实验中得到了验证;然而,MR分析发现这些基因与AD之间没有因果关系.

结论:

• 氧化应激与大动脉剖析的发病和进展有关.
• 已确定的六个与OS相关的生物标志物代表了AD诊断和治疗干预的潜在目标.