通过青少年鱼的大脑转录组学观察到鱼肉的过渡:差异性基因转录,替代拼接和ncRNA活动的复杂相互作用
Radka Symonová1,2, Tomáš Jůza1, Million Tesfaye1,3
1Institute of Hydrobiology, Biology Centre of the Czech Academy of Sciences, České Budějovice, Czech Republic.
概括
年轻的鱼 (Sander lucioperca) 呈现出不同的食策略,浮游生物表现出高调的食欲基因,鱼类动物正在经历大脑发育. 这种可塑性有助于资源开发,减少了竞争.
科学领域:
- 鱼类生态学和鱼类生态学
- 分子生物学和基因组学
- 发展生物学 发展生物学
背景情况:
- 鱼 (Sander lucioperca) 是欧洲淡水生态系统中的主要掠食鱼.
- 年轻的 (YOY) 呈现出两种不同的尺寸类别和养协会:较小的海底浮游生物和较大的底层鱼类.
- 了解鱼类饮食转变的分子基础对于渔业管理和生态研究至关重要.
研究的目的:
- 为了研究底层的分子机制的饮食切换从浮游生物到鱼类在YOY.
- 为了比较浮游生物和鱼类 YOY 鱼子队的脑转录组.
- 识别与不同养策略和发育阶段相关的基因和途径.
主要方法:
- 长期鱼类调查以确定YOY鱼的大小分布.
- 不同的YOY皮克伯奇亚队的脑转录组比较分析.
- 路径丰富分析和差异转录和替代拼接基因的识别.
主要成果:
- 在浮游生物和鱼类 YOY pikeperch 之间发现了 148 个不同的转录基因.
- 鱼类食者表现出与原和细胞外矩阵生成相关的基因的调节.
- 浮游生物表现出非肌肉肌素 (NMM) 和调节食欲的神经基因的上调,包括snoRNA U85.5.
结论:
- 在YOY鱼中转向食鱼的转变可能是由贪驱动的,而食鱼体验动态的大脑发育.
- 发育可塑性允许延长青少年发育,使资源开发和减少种内竞争成为可能.
- 基因表达模式揭示了独特的分子适应,支持鱼早期发育的不同养策略.
关键词:
(Sander (Stizostedion) lucioperca) 这座球场的地址是大脑转录组 转录组是大脑的转录组.人食主义 (cannibalism) 是一种食人行为.发展性可塑性 发展性可塑性不同时代的异时代性斯诺RNA 斯诺RNA 是一种
