目标条件扩散产生强大的TNFR超级家族抗剂和激动剂
Matthias Glögl1,2, Aditya Krishnakumar1,2, Robert J Ragotte1,2
1Department of Biochemistry, University of Washington, Seattle, WA, USA.
使用随机噪声自由扩散的计算蛋白质设计成功地产生了针对瘤死因受体1 (TNFR1) 等具有挑战性的高亲和度结合剂. 这种方法可以精确控制特异性和功能,预示着蛋白质工程的新时代.
科学领域:
- 计算生物学
- 蛋白质工程
- 结构生物学
背景情况:
- 在当前的蛋白质设计方法中,为具有挑战性的目标设计高亲和蛋白质结合剂,特别是具有瘤死因受体1 (TNFR1) 等平面和极面的蛋白质结合剂,仍然是一个重大障碍.
- 与原生蛋白质复合体相比,现有的方法往往无法实现精确的形状互补性.
研究的目的:
- 研究一种新的计算方法的有效性,利用随机噪声的自由扩散来产生与形状相匹配的蛋白质结合剂.
- 在具有挑战性的目标TNFR1上测试这种方法,并探索其设计具有可调的亲和性和特异性的结合剂的潜力.
主要方法:
- 使用基于随机噪声自由扩散的计算设计策略.
- 该方法用于设计瘤死因受体1 (TNFR1) 的结合剂.
- 使用部分扩散技术来调节设计的结合剂的特异性.
主要成果:
- 这项研究成功地产生了对TNFR1具有低皮科莫尔亲和力的蛋白质设计.
- 通过部分扩散,可以精确地将结合剂特异性切换到其他相关蛋白质家族成员.
- 设计的蛋白质在具有更高的价值时起到OX40和4 - 1BB标的对抗或超激应作用.
结论:
- 随机噪声的自由扩散是一种可行的计算策略,用于设计高亲和度和高特异性蛋白质结合剂,即使是针对困难的目标.
- 这种in silico方法可以精确控制结合剂的功能 (抗体/抗体) 和特异性,适用于药理相关的标.
- 计算型蛋白质设计即将取代传统的免疫和随机查方法,
更多相关视频
16:07Determination of the Relative Potency of an Anti-TNF Monoclonal Antibody mAb by Neutralizing TNF Using an In Vitro Bioanalytical Method
Published on: September 16, 2017
12:09Use of Single Chain MHC Technology to Investigate Co-agonism in Human CD8+ T Cell Activation
Published on: February 28, 2019
相关概念视频
Cytotoxic T Cells-mediated Immune Response
Immunological surveillance is the ability of immune cells to monitor and eliminate infected cells with intracellular pathogens, neoplastically transformed cells, and cells with non-self antigens. Cytotoxic T cells and NK...
Drugs for Treatment of Crohn's Disease in IBD Using Biologic Agents: Anti-TNF
T Cell Activation and Clonal Selection
Naive T cells that have not yet encountered an antigen express two primary CD...
Targeted Cancer Therapies
There are several types of targeted therapies against...
TGF - β Signaling Pathway
Transducer Mechanism: Enzyme-Linked Receptors
Major types that are helpful drug targets include:
