从同一单细胞中并行测量转录组和蛋白质组,使用纳米滴体分裂
James M Fulcher1, Lye Meng Markillie2, Hugh D Mitchell2
1Environmental Molecular Sciences Laboratory, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, WA, 99354, USA. james.fulcher@pnnl.gov.
Nature communications
|December 5, 2024
概括
我们开发了nanoSPLITS,这是单细胞多组学的一个新平台. 这项技术可以同时进行转录组和蛋白质组分析,为细胞过程和细胞类型识别提供更深入的生物学见解.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 单细胞多组学对于理解复杂的生物系统至关重要.
- 现有的方法在从同一细胞中对转录组和蛋白质组进行全面的分析方面面临挑战.
- 需要先进的技术来整合单细胞水平的转录组和蛋白组数据.
研究的目的:
- 引入nanoSPLITS,这是一个用于单细胞的同时转录组和蛋白质组分析的集成平台.
- 为了证明纳米SPLITS对于深度和精确的多原子测量的能力.
- 应用纳米SPLITS用于研究细胞循环调节和确定初级组织中的细胞类型.
主要方法:
- 纳米SPLITS (纳米滴分离用于链接多模式调查的痕迹样本) 平台.
- 用于全球转录组概况的RNA测序.
- 基于质谱的蛋白质组学用于全球蛋白质组概况.
- 适用于循环素依赖性激酶1抑制细胞和人类胰腺小岛.
主要成果:
- 纳米SPLITS实现了高测量精度,用于单细胞的深度蛋白质和转录形状分析.
- 信号事件与CDK1抑制细胞中的全球蛋白和mRNA一起量化,揭示了细胞周期调节的洞察力.
- 通过映射转录基因数据,nanoSPLITS使人类胰腺小岛中未知的细胞类型和蛋白质标记物的有效识别成为可能.
结论:
- 纳米SPLITS被确立为一个强大的多原子技术,整合了全球蛋白质组学和转录组学.
- 该平台提供了对细胞机制的关键见解,包括信号通路和细胞身份.
- 预计nanoSPLITS对于通过综合单细胞分析来推进对生物系统的理解至关重要.
