病毒度方法在废水中检测病毒概况时存在偏差
Naeema Cheshomi1,2, Absar Alum1,2, Matthew F Smith3
1School of Sustainable Engineering and the Built Environment, Arizona State University, Tempe, Arizona, USA.
Applied and environmental microbiology
|December 6, 2024
概括
比较基于废水的流行病学 (WBE) 的病毒度方法至关重要. 聚乙烯糖醇沉 (PEG) 和免疫磁纳米颗粒 (IMNP) 通常检测到比电负膜过 (EMF) 更多的病毒类型,最大限度地减少了假阴性.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
背景情况:
- 基于废水的流行病学 (WBE) 依赖于准确的病毒检测方法.
- 病毒度方法由于复杂的废水矩阵和较低的病毒载荷,显著影响WBE的有效性.
- 现有的方法显示了可变的检测效率,需要进行比较性能的评估.
研究的目的:
- 为了比较三种常见病毒度方法的疗效:聚乙烯糖醇沉 (PEG),免疫磁纳米粒子 (IMNP) 和电负膜过 (EMF).
- 评估这些方法对废水样本中的病毒分析对WBE应用的影响.
- 识别与不同度技术相关的潜在偏差和虚假负面.
主要方法:
- 使用PEG,IMNP和EMF度方法处理了流入和废水样本.
- 通过DNA/RNA量化和测序来分析缩的病毒颗粒.
- 在所有方法和样本类型中进行了各种人类病毒的检测和识别.
主要成果:
- 所有方法都检测到SARS-COV-2,天体病毒和C型肝炎病毒.
- 与EMF (16 in influent) 相比,PEG和IMNP方法检测到的病毒类型数量更高 (分别为20个和21个).
- 通过特定方法独特检测到某些病毒,突出了特定方法的偏差和EMF的虚假阴性结果的可能性.
结论:
- 病毒度方法的选择极大地影响了WBE研究中的病毒检测和分析.
- 与EMF相比,PEG和IMNP在检测更广泛的病毒范围方面表现优越.
- 实施优化度技术对于最大限度地减少偏差,避免假阴性,并确保WBE在公共卫生监测中的可靠性至关重要.
