在Alternaria alternata和A. arborescens中,来自西红的种群复合体中的哈普罗型多样性和原型学
Lilija Dučkena1, Nabahat Bessadat2, Nelly Bataillé-Simoneau3
1Institute of Soil and Plant Sciences, Latvia University of Life Sciences and Technologies, Liela Street 2, LV-3001, Jelgava, Latvia; University of Angers, Institut Agro, INRAe, UMR 1345 IRHS, SFR 4207 QUASAV, Beaucouzé Cedex, 49070, France.
由Alternaria物种引起的西红叶斑显示出高度的遗传多样性和潜在的杂交. 主要的Alternaria alternata和Alternaria arborescens类型在不同的宿主中共享,影响疾病管理策略.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 分子遗传学分子遗传学
背景情况:
- 番茄 (Solanum lycopersicum L.) 是一种经常受到真菌病影响的重要作物.
- 由Alternaria物种 (Section Alternaria) 引起的叶斑病对番茄生产构成重大威胁.
- 了解这些病原体的遗传多样性和进化关系对于有效的疾病控制至关重要.
研究的目的:
- 使用综合方法来描述与番茄相关的Alternaria物种.
- 为了研究基因多样性,家族遗传关系,和潜在的杂交在Alternaria部分Alternaria.
- 识别与这些真菌病原体相关的关键基因和类型.
主要方法:
- 来自四个国家的72种Alternaria菌株的形态表征.
- 在番茄植物上进行致病性测定.
- 使用RNA聚合酶II第二大子单元 (rpb2),ASA-10和ASA-19基因进行多位基因基因分析.
- 哈普洛型分配和DNA多态度分析,包括单核酸多态度 (SNP).
主要成果:
- 观察到显著的表型变异,大多数菌株表现为非致病性,缺乏AAL毒素基因 (ALT1).
- 遗传学分析证实了Alternaria alternata,Alternaria arborescens,Alternaria longipes和Alternaria postmessia物种复合物的存在.
- 检测到的证据表明,可能会在两种谱系之间进行重组和杂交 (例如,替代树枝,替代长).
- 在Alternaria部分内发现了很高的遗传多样性,在位点和血统中存在不同程度的SNP和单元类型.
- 总共有16个和6个多位点的哈普洛类型分别在替代物和树木系中被确定.
- 在rpb2位点上的A. alternata和A. arborescens的主要单元类型在不同的宿主植物中共享.
结论:
- 与番茄相关的Alternaria种群表现出大量的遗传多样性和复杂的进化动态,包括杂交.
- 许多孤立品中缺乏病原性和ALT1基因表明了适应或专业化.
- 宿主之间共享的单元类型表明了病原体传播的可能性,并强调了需要综合疾病管理策略的必要性.
- 对再组合和宿主-病原体相互作用的进一步研究是有必要的.
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