基因提取,PCR放大,测序和生物信息分析对使用PacBio长时间读取的amplicon测序的食品相关模拟社区的影响

Mareike Baer1, Lisa Höppe2, Waldemar Seel3

  • 1Institute of Nutritional and Food Sciences, Food Microbiology and Hygiene, University of Bonn, Friedrich-Hirzebruch-Allee 7, 53115, Bonn, Germany. mabaer@uni-bonn.de.

BMC microbiology
|December 6, 2024
PubMed
概括

长读测序准确地描述了食品微生物组,但PCR放大引入了偏差. 与模拟社区进行基准测试对于可靠的食品微生物组分析和风险评估至关重要.