刺冠状病毒的基因组特征和跨物种传播潜力
Andreia V S Cruz1, Sérgio Santos-Silva1, Luís Queirós-Reis1
1Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar (ICBAS), Universidade do Porto, 4050-313 Porto, Portugal.
One health (Amsterdam, Netherlands)
|December 9, 2024
概括
在葡萄牙刺中检测到冠状病毒,包括新型β冠状病毒和α冠状病毒. 这一发现凸显了潜在的跨物种传播风险,以及对对刺冠状病毒流行病学的进一步研究的需要.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 动物传播疾病流行病学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 在人类中出现新型冠状病毒 (SARS-CoV,MERS-CoV,SARS-CoV-2) 构成重大公共卫生威胁.
- 在欧洲刺中发现β冠状病毒引发了对潜在的动物传播的担忧.
- 对冠状病毒在野生动物群体 (如) 中的多样性和传播的理解有限.
研究的目的:
- 调查葡萄牙的刺中冠状病毒的存在和遗传多样性.
- 评估从刺传播冠状病毒的跨物种传播潜力.
- 描述在刺中发现的新型冠状病毒菌株及其与已知的病毒的关系.
主要方法:
- 来自110只刺的便样本使用广谱嵌套RT-PCR试验进行了分析,该试验准了RNA依赖RNA聚合酶 (RdRp) 基因.
- 阳性样本进行了基因组测序,以确定病毒遗传多样性和进化关系.
- 进行了计算型蛋白质-蛋白质对接研究,以预测刺冠状病毒尖端蛋白和宿主细胞受体之间的相互作用.
主要成果:
- 24.5%的刺便样本检测出冠状病毒阳性,主要属于Betacoronavirus属.
- 这项研究报告了对刺中的Alphacoronaviruses的首次鉴定,其高序列与蝙蝠冠状病毒 (Alphacoronavirus miniopteri) 相同.
- 基因组测序揭示了一种新型的betacoronavirus,与Betacoronavirus erinacei有93.5%的相似性,计算研究表明与各种哺乳动物细胞受体的潜在相互作用.
结论:
- 刺有各种各样的冠状病毒,包括以前未被描述的α冠状病毒.
- 这些发现强调了刺作为具有动物感染潜力的冠状病毒潜在储存库的重要性.
- 进一步的研究至关重要,以阐明刺冠状病毒的跨物种传播动态和受体使用.
