MuMu:用于基于滴滴的同时单核RNA和ATAC-seq系统的样本复合协议

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 分子生物学分子生物学
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 在高通量生物实验中,样品多重复合对于降低成本和批量效应至关重要.
• 同时的单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和ATAC测序 (scATAC-seq) 提供了全面的多原子洞察力.
• 现有的多原子分析协议可能是昂贵和劳动密集型的,限制了可访问性.

研究的目的:

• 引入一种用于多重化单细胞多原子分析的新方案.
• 为了使单个核从多样化的生物样本聚合在多原子造型之前.
• 为了降低与单核多原子实验相关的总体成本和技术负担.

主要方法:

• 开发一个定制的TN5转基因组,以实现高效的转基因转化.
• 集核聚合与同时单核RNA测序 (snRNA-seq) 和单核ATAC测序 (snATAC-seq) 的集成.
• 图书馆准备,测序和数据预处理步骤的详细描述,用于多重复合多组 (MuMu) 协议.

主要成果:

• 成功实施了一项协议,允许从多个样本中聚合单个核,同时进行snRNA-seq和snATAC-seq.
• 展示关键步骤,包括定制的转子体组装,转位反应,核聚合和图书馆准备.
• 多复合多分子组 (MuMu) 协议显著降低了sn-Multiome实验的成本.

结论:

• 多复合多分子 (MuMu) 协议为同时 snRNA-seq 和 snATAC-seq.提供了一种简化且具有成本效益的方法.
• 这种方法通过降低实验障碍,促进了大规模的多原子研究.
• MuMu准备在各种研究领域提高单细胞多原子分析的可访问性和效率.