克里斯皮屏幕揭示了人类单细胞生长的 lncRNA 调节器

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 细胞生物学 细胞生物学

背景情况:

• 长非编码RNAs (lncRNAs) 是生物过程的关键调节者,但大多数超过20,000个注释的人类 lncRNAs的功能仍然是未知的.
• 了解 lncRNA 功能对于破译复杂的生物途径和疾病机制至关重要.

研究的目的:

• 通过使用高通量CRISPRi屏幕,识别调节人类单细胞活力的功能性lncRNAs.
• 描述新型lncRNAs在单细胞增殖和存活中的作用.

主要方法:

• 在人类单细胞细胞系THP1中进行了高通量CRISPR干扰 (CRISPRi) 屏幕,以确定细胞活力所必需的lncRNAs.
• 使用基因抑制技术和RNA测序 (RNA-seq) 验证和表征了顶级 lncRNA 候选者.

主要成果:

• 确定了38个影响单细胞活力的lncRNA,包括两个新的基因间命中:RP11-542M13.2 (LNCRMP) 和OLMALINC.
• 抑制LNCRMP和OLMALINC显著损害了THP1细胞的增殖.
• 通过RNA-seq揭示,LNCRMP调节了亲细胞突变途径,而OLMALINC影响了细胞循环相关的基因,这表明它具有cis调节作用.

结论:

• LNCRMP和OLMALINC对于人类单细胞的增殖和活力至关重要,它们在 cis 中起作用,调节邻近的基因.
• 高通量查是一种有效的策略,用于发现与单细胞存活等关键细胞过程有关的功能性 lncRNA.