多种组学分析揭示了微生物多样性和活性,通过Theobroma cacao的自发发酵
Ynara da Costa Fonseca1,2, Celina Eugenio Bahule3, Hector Herrera4,5
1Graduate Program in Agricultural Applied Biotechnology, Federal Rural University of Amazonia, President Tancredo Neves Ave, 2501, Belém, CEP 66.077-830, Brazil.
Heliyon
|December 10, 2024
概括
这项研究结合了metabarcoding和metaproteomics,揭示了可可发酵期间的微生物活动. 它确定了关键的细菌和酵母菌种,突出了新型微生物和多omics方法的重要性,以获得全面的发酵见解.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 生物技术是生物技术.
- 食品科学 食品科学 食品科学
背景情况:
- 泰奥布罗玛可可 (可可) 的自发发酵对于风味的发展至关重要.
- 在这个过程中了解活跃的微生物群对于优化发酵结果至关重要.
- 以前的研究可能因为方法上的局限性而忽略了某些微生物参与者.
研究的目的:
- 为了研究自发可可发酵过程中的微生物群落动态组成.
- 为了评估蛋白质的多样性,并在120小时的发酵期间识别活跃的微生物.
- 为了比较metabarcoding和metaproteomics在表征发酵微生物群中的有效性.
主要方法:
- 采用了一种结合的元编码和元蛋白质学方法.
- 在120小时的发酵过程中收集和分析了样本.
- 评估了蛋白质多样性和微生物遗传标记.
主要成果:
- 最初 (0-72h),主要与Theobroma可可和酵母有关.
- 在72小时后,细菌显著增加,而与可可相关的则减少.
- 像Microvirga,Inquilinus,Candolleomyces和Lasiodiplodia这样的新型属被确定为代谢活跃的.
结论:
- 超级编码和超级保护组学显示了主要属的一致检测,但当它们一起使用时,会揭示出独特的见解.
- 这项研究确定了以前未经探索的属,强调了需要多omics战略.
- 将metabarcoding和metaproteomics等技术结合起来,对于全面了解自发发酵过程至关重要.
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