在agar媒体上使用高通量诱导体查发现神秘的自然产品
Seoung Rak Lee1,2, Étienne Gallant1, Mohammad R Seyedsayamdost1,3
1Department of Chemistry, Princeton University, Princeton, New Jersey 08544, United States.
Biochemistry
|December 10, 2024
概括
在上进行的高通量诱导体选 (HiTES) 成功识别了Burkholderia物种的新型自然产品. 这种方法可以获取液体培养中未发现的化合物,揭示了新的代谢物,如甲基A和B.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 自然产品化学 自然产品化学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 微生物基因组包含生物合成基因集群 (BGCs),它们产生有价值的化合物,但通常很难表达.
- 诱导这些BCG的传统方法,如液体培养,在获取所有潜在产品方面存在局限性.
- 研究"神秘"的BGC对于发现具有潜在应用的新型天然产品至关重要.
研究的目的:
- 探索高吞吐量诱导体选 (HiTES) 在上发现新型天然产品的潜力.
- 为了研究*Burkholderia plantarii*和*Burkholderia gladioli*的代谢物生产,使用基于的HiTES.
- 从这些细菌物种中识别和描述新的化合物及其相应的BGC.
主要方法:
- 在*Burkholderia plantarii*和*Burkholderia gladioli*的固体基上应用高通量诱导体选 (HiTES).
- 从阿加基HiTES获得的代谢物概况与传统液态培养的代谢物概况的比较.
- 生物信息学和遗传学分析以确定负责新代谢产生的生物合成基因集群 (BGCs).
主要成果:
- 识别几种新型天然产品,这些新型天然产品仅在亚格板上生产,而不是在液态培养中生产.
- 发现了两种新代谢物,伯克乙基A和B,其特点是异常的*m*-乙基基部分.
- 通过综合生物信息学和遗传学研究,成功识别了甲基A和B的相关BGC.
结论:
- 基于阿加的HiTES是一种强大而有前途的自然产品发现策略,特别是用于访问来自神秘BGC的产品.
- 即使是经过广泛研究的微生物菌株也可以在采用替代培养和诱导方法时产生新的代谢物.
- 这项研究强调了微生物天然产品生物合成的未开发潜力,以及创新的查方法的重要性.
