探测我的路径 (PmP):一个门户探索人类反应体的化学覆盖

科学领域:

• 化学生物学是化学生物学.
• 系统生物学 系统生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 了解细胞通路及其相关表型对于生物研究至关重要.
• 使用化学探针进行细胞通路的药理学调制是一个日益增长的研究领域.
• 在直接将化学工具与特定的细胞通路连接的资源中存在差距.

研究的目的:

• 开发一个全面的数据库,将化学探测器和化学基因组化合物映射到人类的途径.
• 为研究人员提供一种资源,以探索细胞通路的化学工具覆盖范围.
• 通过化学调制,促进发现新的途径-表型关联.

主要方法:

• 开发了探测器我的路径 (PmP) 数据库.
• 来自Reactome数据库的人类途径的综合数据.
• 将化学探针和化学基因组化合物映射到通路内的蛋白质.
• 实现了一个用于浏览和搜索数据的Web界面.

主要成果:

• 在Reactome中,PmP提供了化学工具对所有人类通路的直接映射.
• 数据库允许用户搜索化合物,蛋白质或途径.
• 用户可以识别具有有限化学覆盖的途径,并探索连接物化学.
• 研究人员可以找到特定蛋白质或感兴趣的途径的探针.

结论:

• 探测器我的路径 (PmP) 解决了将化学探测器与细胞路径连接的集中资源的需求.
• 该数据库支持化学家和细胞生物学家在他们的研究工作.
• PmP将每年更新,并扩展新的化学工具.