使用网络毒理学,分子对接和机器学习策略,有效分析甲状腺毒性和乙三酸的机制
Yujian Lan1, Qingping Peng1, Bowen Fu2
1School of Integrated Traditional Chinese and Western Medicine, Southwest Medical University, Luzhou, Sichuan 646000, China; Department of Orthopaedics, The Affiliated Traditional Chinese Medicine Hospital, Southwest Medical University, Luzhou, Sichuan 646000, China.
Toxicology
|December 10, 2024
概括
环境污染物乙三酸 (ATBC) 可能会损害甲状腺健康. 这项研究确定了关键的分子标和途径,如受ATBC影响的FoxO信号传输,为甲状腺功能障碍机制提供了洞察力.
科学领域:
- 环境毒理学环境毒理学
- 分子内分泌学分子内分泌学
- 计算生物学是一种计算生物学.
背景情况:
- 环境污染物,包括像乙二酸盐 (ATBC) 这样的增塑剂,越来越多地与甲状腺功能障碍有关.
- 通过ATBC影响甲状腺健康的精确分子机制在很大程度上仍未被阐明.
- 了解这些机制对于解决环境污染物引起的甲状腺疾病日益严重的公共卫生问题至关重要.
研究的目的:
- 为了研究乙三酸 (ATBC) 对甲状腺的复杂影响.
- 为了确定ATBC诱导的甲状腺功能障碍所涉及的分子标和途径.
- 为了解和潜在地减轻ATBC对甲状腺健康的不良影响提供理论框架.
主要方法:
- 使用广泛的数据库挖掘 (ChEMBL,STITCH,GEO) 来识别ATBC-甲状腺相关的目标.
- 应用STRING和Cytoscape进行目标选,随后使用机器学习进行核心目标识别 (CBX5,HADHB,TRIM33,TP53,CUL4A).
- 进行了基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 路径分析 (DAVID) 和分子对接模拟 (MOE).
主要成果:
- 确定了19个潜在的ATBC-甲状腺点,精细化为5个核心点:CBX5,HADHB,TRIM33,TP53和CUL4A.
- 途径分析显示,FOXO信号通路和脂肪酸代谢在ATBC的影响中显著参与.
- 分子对接证实了ATBC和已识别的核心目标之间强烈的结合亲缘关系.
结论:
- 这项研究阐明了ATBC可能诱导甲状腺损伤的关键分子机制.
- 已确定的目标和途径为了解ATBC在甲状腺功能障碍中的作用提供了基础.
- 这些发现支持开发策略,以预防或治疗与ATBC暴露相关的甲状腺疾病.
