纵向转录组分析揭示了传统中国医学中不同的基因表达模式,上呼吸道感染的综合征
Hao Zou1,2, Changrui Huang1,2, Qinqi Feng1,2
1Graduate School of Beijing University of Chinese Medicine, Beijing, China.
Frontiers in genetics
|December 11, 2024
概括
传统中医综合症 在上呼吸道感染中,风冷 (WC) 和风热 (WH) 呈现出不同的基因表达特征. WC涉及线粒体功能障碍,而WH显示下调的TGF-β和Wnt/β-catenin通路,有助于精确的诊断.
科学领域:
- 综合医学是一个整体的医学.
- 基因组学就是基因组学.
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- 风冷 (WC) 和风热 (WH) 是常见的传统中医 (TCM) 综合征,用于上呼吸道感染 (URTI).
- 存在明显的临床特征,但转录组差异以前不清楚.
- 了解分子基础可以完善对URTI的TCM诊断.
研究的目的:
- 阐明与WC和WH综合征相关的转录变化.
- 为了确定每个综合征的独特分子标记.
- 开发一个分类器来区分WC和WH综合征.
主要方法:
- 从WC患者,WH患者和健康对照患者的外周血液的转录组测序.
- 对差异表达基因和丰富通路的分析.
- 使用已识别的标记基因开发机器学习分类器.
主要成果:
- 在WC/WH综合征和健康对照之间观察到不同的基因表达特征.
- WH综合征显示TGF-β和Wnt/β-catenin通路的下调.
- 与WH相比,WC综合征表现出下调的氧化酸化通路,恢复后正常化.
- 一个随机的森林分类器在区分WC和WH综合征时取得了88%的准确性.
结论:
- 转录组分析支持WC和WH综合征的独特分子签名,使TCM诊断更加精确.
- WC综合征的特征是线粒体功能障碍.
- WH综合征与下调的TGF-β和Wnt/β-catenin信号通路有关.


