MacGen:用于基于结构的宏循环设计的Web服务器
Zhihan Zhang1,2, Dongliang Ke1,2, Chengshan Jin1,2
1Shanghai Engineering Research Center of Molecular Therapeutics & New Drug Development, School of Chemistry and Molecular Engineering, East China Normal University, Shanghai 200062, China.
Journal of chemical information and modeling
|December 12, 2024
概括
MacGen是一款用于基于结构的宏循环设计的新网络工具. 它有助于药物设计人员找到合适的链接器,以创建新的宏循环,改善药物特性.
科学领域:
- 药用化学 医学化学
- 计算机化药物设计技术
- 化学生物学 化学生物学
背景情况:
- 宏循环是药物设计的关键,增强结合亲和力,选择性和细胞透性.
- 合理的药物设计越来越多地利用宏环化合物.
研究的目的:
- 介绍MacGen,一个基于结构的宏循环设计的网络工具.
- 促进识别适合于宏观循环形成的连接器.
主要方法:
- 麦肯基因识别了用于循环化的联结体退出向量对.
- 它搜索一个索引的3D链接器数据库,寻找兼容的链接器.
- 该工具提供可配置参数,用于定制链接器选择.
主要成果:
- MacGen有效地找到匹配出口向量的几何约束的3D链接器.
- 一个索引数据库可以加速获取各种链接器.
- 该工具支持对宏环化学空间的探索.
结论:
- MacGen为基于结构的宏循环设计提供了一个用户友好的平台.
- 它可以快速探索宏环药物候选药物.
- 该工具可供研究人员在线访问.


