古代杂交促进了阿克罗波拉珊瑚的多样化

科学领域:

• 海洋生物学 海洋生物学
• 进化遗传学 进化遗传学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 内向,即通过杂交和逆交物种之间基因的转移,可以使进化研究复杂化.
• 对于珊瑚礁生态系统至关重要的Acropora属有不清楚的多样化前侵入的历史.
• 之前对Acropora的差异时间估计没有考虑潜在的内进影响.

研究的目的:

• 为了调查Acropora珊瑚属中古代侵入的存在和程度.
• 评估内进化的对植物遗传重建和分歧时间估计在Acropora的影响.
• 探索内进的作用在Acropora的进化辐射.

主要方法:

• 来自多个Acropora物种的全基因组蛋白质编码序列的分析.
• 使用三重位置分析推断内进事件的推断.
• 使用多维缩放对核位点进行聚类,以评估遗传学异质性.
• 使用具有不同程度内进化的基因组进行分离时间估计.

主要成果:

• 在Acropora全基因组序列中检测到古代内侵的证据.
• 大约21.9%的三位点显示出内进化的证据,在多样化之前,遗传贡献高达30.9%.
• 核位置聚类中的异质性导致了各种各样的遗传学关系.
• 估计多样化的时间是中期到晚期的米奥森,当计入内进时.

结论:

• 古老的侵入性杂交在Acropora珊瑚的全基因组进化和辐射中发挥了重要作用.
• 内进事件发生在Acropora多样化之前,对它们的遗传构成做出了重大贡献.
• 准确的遗传学重建和差异时间估计需要考虑内进化的影响.