基于多个机器学习模型,在脏清细胞癌中开发了与中心细胞放大相关的特征

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 免疫治疗是一种免疫疗法.

背景情况:

• 中心细胞放大 (CA) 与瘤发生,转移和侵袭有关.
• 了解CA在脏清细胞癌 (KIRC) 预后和治疗反应中的作用至关重要.

研究的目的:

• 为KIRC.开发一个与中心体放大相关的签名.
• 调查签名预测预后和免疫治疗反应的能力.

主要方法:

• 使用TCGA-KIRC数据集进行签名构建 (随机生存森林,考克斯回归).
• 使用ICGC和GEO数据集验证的签名.
• 分析了突变,免疫景观和免疫疗法反应.
• 通过单细胞RNA测序 (GSE159115) 进行配置的枢纽基因表达.

主要成果:

• 确定了22个CA相关的预后基因;7个形成了预后指数 (CAAPI).
• 高CAAPI与增加的死亡率,突变和免疫抑制相关.
• 在高CAAPI组中,免疫疗法效果较差.
• CDK5RAP3在瘤细胞中表达高.

结论:

• CA显著影响KIRC瘤微环境和免疫治疗反应.
• CAAPI作为一个潜在的生物标志物,用于预测KIRC预后和免疫治疗疗效.