组织活检中的综合DNA估计和液体活检中的检测,通过针对HBV的NGS测定

科学领域:

• 肝病学 肝病学是一种肝病学.
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 集成的HBVDNA (iDNA) 在乙型肝炎病毒 (HBV) 病原发生,治疗反应和肝细胞癌 (HCC) 预测中至关重要.
• 精确检测和定量iDNA对于了解HBV疾病进展和治疗策略至关重要.

研究的目的:

• 开发和验证一种敏感,无偏见的HBV杂交捕获下一代测序 (HBV-NGS) 试验.
• 检测和量化HBV-宿主连接序列 (HBV-JS) 以估计组织活检中的iDNA分数.
• 评估HBV-NGS在液体活检中的HBV遗传分析的实用性.

主要方法:

• 使用HBV-NGS测定细胞系,组织活检和匹配的血和尿液样本.
• 开发了用于量化HBV-JS的交点特异性qPCR (JS-qPCR) 试验.
• 使用HBV-JS序列创建并验证了一个iDNA估计模型.

主要成果:

• HBV-NGS表现出高均性,跨基因型 (A-D) 的可重现性,以及对iDNA检测的0.1%敏感性.
• 从HBV-HCC细胞系中特征化了iDNA序列和结构.
• 在所有测试的体液中成功检测到HBV-JS,无论病毒载量如何,通过液体活检实现HBV遗传分析.

结论:

• HBV-NGS试验能够在组织活检中对iDNA分数进行可靠的估计,即使血清HBVDNA低或无法检测.
• 通过使用这种NGS方法进行液体活检,可以实现敏感的HBV遗传分析.
• 基于NGS的方法具有促进HBV管理和患者护理的巨大潜力.