对海绵聚合因子的蛋白质组学分析表明,在动物中,认知和粘附具有古老的工具包

科学领域:

• 进化生物学是进化生物学.
• 生物化学 生物化学
• 细胞生物学 细胞生物学

背景情况:

• 海绵 (Porifera) 是研究细胞粘附和全认知的早期动物模型.
• 海绵中的再生取决于聚合因子 (AF),这是一个以前被认为是海绵特异性的蛋白质复合体.

研究的目的:

• 为了确定海绵聚合因子 (AF) 的额外组件和相互作用蛋白质.
• 为了比较海绵AF蛋白与参与双菌细胞相互作用的蛋白质.
• 研究细胞粘附机制的进化起源.

主要方法:

• 使用定量蛋白质组学来识别 *Clathria prolifera* 中的AF组件.
• 生物信息分析,包括AlphaFold,用于预测蛋白质结构和相似性.
• 进行了比较分析,与来自双菌的蛋白质进行了比较分析.

主要成果:

• 证实MAFp3/p4蛋白质是主要AF组件;calx-beta和花环域蛋白质被认为是额外的组件.
• 结构分析揭示了AF域与其他动物的域之间的相似性,此前因序列分歧而隐藏.
• 与免疫球蛋白 (Ig) 和Fn3域保持的C-终端表明一个共同的AF相互作用接口.
• MAF相关蛋白1被确定为AF与细胞表面之间的潜在联系,类似于Ig超族的粘附分子.

结论:

• 这项研究揭示了一种古老的工具包,保存了所有参与细胞-细胞和细胞-细胞外基质相互作用的蛋白质域.
• 这些发现表明,在动物王国中,细胞粘附和全认知机制的共同进化起源.