来自Schizosaccharomyces pombe活细胞和固定细胞的素H3 (hht1) 的单分子追踪数据集

科学领域:

• 细胞生物学 细胞生物学
• 生物物理学的生物物理.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 单分子追踪 (SMT) 为观察活细胞中的蛋白质动态提供了高时空分辨率.
• 在各种模型系统中,SMT被广泛使用,但尚未应用于裂变酵母Schizosaccharomyces pombe.
• Schizosaccharomyces pombe是一种有价值的模型生物体,用于研究基本的生物过程.

研究的目的:

• 建立一个单分子追踪数据集,用于裂变酵母Schizosaccharomyces pombe.
• 为了对染色素结合的 histone H3 (Hht1) 和自由扩散的 GFP 的扩散参数进行基准测试.
• 为区分结合色氨酸的分子和自由分子提供资源,并验证跟踪方法.

主要方法:

• 在活的和固定的Schizosaccharomyces pombe细胞中利用单分子追踪.
• 追踪染色素结合的素H3 (Hht1) 和在核内自由扩散的GFP.
• 分析了扩散参数,包括扩散系数,平均平方位移,结合分子的分数和停留时间.

主要成果:

• 为S. pombe.生成了全面的单分子跟踪数据集.
• 在S. pombe核中为Hht1和GFP建立了基准扩散参数.
• 证明了这些参数的实用性,用于区分绑定和自由分子.

结论:

• 单分子追踪现在适用于Schizosaccharomyces pombe,扩大其在酵母研究中的应用.
• 提供的数据集和参数是研究S. pombe.蛋白质动态的关键资源.
• 这项工作促进了跟踪软件的验证和基于机器学习的跟踪算法的开发.