在人体便样本中通过脉冲元转录学识别新型果糖糖体细菌消费者

科学领域:

• 微生物组研究的研究.
• 营养科学 营养科学
• 转基因组学是指转基因组学.

背景情况:

• 食纤维,或甘氨酸,显著影响肠道微生物群的组成和宿主健康.
• 识别那些代谢甘氨酸的特定肠道细菌对于理解益生菌功能和治疗应用至关重要.
• 果酸寡糖 (FOS) 是众所周知的益生菌,但并非所有细菌消费者都被确定.

研究的目的:

• 通过脉冲元转录学方法识别新型细菌种群,这些新型细菌种群可以代谢果糖 (FOS).
• 扩大对人类肠道微生物群中的FOS代谢的理解.
• 建立一种方法来发现新的益生菌消费者并研究它们的机制.

主要方法:

• 人类便微生物群落的短期化,使用FOS或银河作为唯一的碳来源.
• 采用了元转录组学,整个元基因组测序和16S amplicon测序.
• 通过在定义的介质中监测生长,验证已识别的果糖发酵细菌 (Blautia物种).

主要成果:

• 脉冲化诱导了参与碳水化合物代谢的基因,包括糖化酸酶家族32个基因.
• 在以前未被报告为果实素消费者的布劳提亚物种中,FOS代谢转录显著过度表达.
• 实验验证证了各种Blautia物种发酵果糖的能力.

结论:

• 脉冲元转录组学方法有效地识别了新型细菌的益生菌消费者.
• 蓝物种被确定为重要的,以前未被认可的FOS消费者.
• 这项研究增强了对肠道微生物群中碳水化合物活性酶 (CAZymes) 的预微生物代谢的理解.