基于PCR的周期值切断值来诊断胃肠道感染

科学领域:

• 临床微生物学 临床微生物学
• 传染性疾病 传染性疾病
• 分子诊断学 分子诊断学

背景情况:

• 胃肠道感染 (GII) 诊断正在从传统培养方法转向高度敏感的分子测定,主要是聚合酶链反应 (PCR).
• 这种转变引发了人们对由于PCR的敏感性和假阳性结果的可能性而导致潜在的过度诊断的担忧,这会影响患者管理.

研究的目的:

• 为了比较分子 (PCR) 与便培养试验的性能,以检测胃肠道病原体.
• 为了确定PCR检测感染的阳性培养结果的最佳周期值 (Ct) 截止值.
• 评估Ct值在解释GIIPCR结果中的临床实用性.

主要方法:

• 从2022年10月到2023年2月,对6000名怀疑GII的患者记录进行了回顾性审查.
• 来自疑似GII患者的便样本使用Seegene Allplex GI-Bacteria (I) PCR试验进行了分析.
• 具有PCR阳性的样本在特定的基上进行细菌培养,以确认病原体的存在并与CT值相关联.

主要成果:

• 在356个PCR阳性样本中,196个 (55.1%) 通过便培养得到确认.
• 在培养阳性和培养阴性样本之间观察到*Shigella* spp.,*E. coli* O157和*Campylobacter* spp.的平均Ct值的显著差异. (所有P<0.004) 的情况.
• *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella* spp. *Shigella spp. *Shigella spp. *Shigella spp. 呈现出最低的Ct切断点在27.14,这表明真正感染的可能性更高.

结论:

• 在PCR阳性样本中,负的培养结果可能表明细菌负载较低或生物不活跃,而假阳性也可能发生.
• 实施病原体特定的Ct值可以帮助减少分子测定中的不准确诊断.
• 建议在临床表现的同时考虑Ct值,或对PCR阳性结果进行确认性便培养,以准确诊断GII.