通过发现和复制全表观基因组协会研究,将肠道微生物组与宿主DNA甲基化联系起来

科学领域:

• 人类微生物组研究研究
• 表观遗传学和基因调节
• 基于人口的队列研究.

背景情况:

• 人类微生物组在各种生理系统中起着至关重要的作用.
• 肠道微生物群对宿主基因甲基化的影响在很大程度上仍未被探索.
• 了解微生物组与表观基因组之间的相互作用对于人类健康研究至关重要.

研究的目的:

• 为了研究肠道细菌丰富度和人类血液中的基因甲基化模式之间的关系.
• 为了确定与DNA甲基化变化相关的特定微生物种群.
• 探索微生物组在环境因素对表观遗传学影响中的潜在调解作用.

主要方法:

• 利用16S rRNA基因测序在两个荷兰队列 (LifeLines-Deep和荷兰双胞胎注册) 中分析肠道细菌.
• 在LifeLines-Deep队列中采用了猎枪元基因组测序来分析微生物通路.
• 在两个队伍中使用Illumina 450K阵列评估血液DNA甲基化.

主要成果:

• 确定并复制了两个特定的CpG (cg16586104和cg12234533) 与细菌属Eggerthella的丰富性之间的显著关联.
• 对元分析的P值为cg16586104的3.21 × 10-11和cg12234533的4.29 × 10-10 .
• 证明微生物组可以作为环境因素对宿主基因甲基化影响的调解者.

结论:

• 这项研究提供了第一个将人类表观基因组与微生物组联系起来的证据,对Eggerthella发现了复制的关联.
• 这些发现表明肠道微生物组在调解暴露基因对宿主基因甲基化影响中的作用.
• 需要对更大的队列进行进一步的纵向研究来证实这些观察结果.