在HBV转基因小鼠中由P53和Pten淘汰诱导的HCC模型在转录组水平上反映了人类HCC
Zhao Chen1, Jing Yang2,3, Yang Song1,4
1Department of Nutrition and Food Hygiene, School of Public Health, College of Medicine, Qingdao University, Qingdao, China.
Journal of medical virology
|December 20, 2024
概括
选择最好的肝细胞癌 (HCC) 鼠标模型至关重要. 具有P53和Pten淘汰的HBV转基因小鼠模型显示了与人类HCC的最高转录基因相似性,使其成为一个有前途的研究工具.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 翻译研究是翻译研究.
背景情况:
- 为肝细胞癌 (HCC) 研究选择合适的小鼠模型是具有挑战性的,因为变异性.
- 与人类HCC的转录组,免疫和代谢相似性是模型选择的关键因素.
研究的目的:
- 综合比较各种HCC小鼠模型与人类HCC的转录组,免疫和代谢概况.
- 为了确定最合适的HCC小鼠模型,以模仿人类疾病.
主要方法:
- RNA测序 (RNA-seq) 在一种具有P53和Pten淘汰赛 (KO) 的新型HBV转基因小鼠模型上进行.
- 基因表达,免疫微环境和代谢途径的比较分析,使用来自2345个HCC小鼠模型和人类HCC数据集的RNA-seq数据.
- 利用CRISPR/Cas9基因编辑用于模型诱导.
主要成果:
- 在HBV+P53&Pten KO模型中,与人类HCC的总体相似性最高.
- 这种模型显示了瘤和非瘤组织之间差异表达基因 (DEGs) 的显著重叠,类似的免疫细胞透和可比的代谢变化.
- 相比之下,DEN + CCl4诱导的模型显示了最低的转录组相似性和独特的免疫微环境.
结论:
- HBV + P53&Pten KO小鼠模型是HCC研究的一个非常有前途的临床前工具,因为它与人类HCC有很大的相似之处.
- 精确选择HCC小鼠模型对于推进翻译研究和治疗开发至关重要.
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