全基因组序列和LC-Mass用于识别Bacillus licheniformis内的抗菌代谢物
Nourhan K Soliman1, Ahmad M Abbas1,2, Wafaa N El Tayeb3
1Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Pharmacy, Ain Shams University, Cairo, 11566, Egypt.
AMB Express
|December 20, 2024
概括
野生的植物含有产生抗菌素的细菌. 来自Bassia scoparia的Bacillus licheniformis CCASU-B18对抗性病原体表现出广泛的活性,为抗菌素耐药性 (AMR) 提供了潜在的解决方案.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 自然产品化学 自然产品化学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 抗菌素耐药性 (AMR) 是全球主要的健康威胁.
- 野生菌植物是具有抗菌潜力的新型内菌的来源.
- 识别新的抗微生物化合物对于打击AMR至关重要.
研究的目的:
- 从野生Bassia scoparia中分离和识别内/表细菌.
- 描述这些细菌产生的抗微生物代谢产物.
- 评估这些代谢物对抗多药耐药 (MDR) 病原体的潜力.
主要方法:
- 使用标准的微生物技术,隔离内性和性细菌.
- 使用牛津纳米孔技术对有前途的分离物进行全基因组测序 (WGS).
- 抗SMASH和LC-MS/MS分析用于代谢物识别和生物合成基因集群分析.
- 对标准和MDR临床分离物进行抗微生物敏感性测试.
主要成果:
- 细菌菌菌株CCASU-B18从Bassia scoparia中分离出来.
- 该菌株对包括MDR菌株和Candida albicans在内的Gram-阳性和Gram-阴性细菌表现出广泛的活性.
- 确定了六种关键的抗微生物代谢物 (热活性氨基胺A,细菌菌素,李氏素,李氏素,李氏素,素,细菌素).
- 对B. licheniformis CCASU-B18的完整基因组进行了测序,并存储在GenBank (加入:CP157373).
结论:
- 细菌菌株CCASU-B18是新型抗菌化合物的有希望的来源.
- 已识别的代谢物及其生物合成途径需要进一步研究以开发治疗方法.
- 未来的研究应该专注于优化代谢物生产和对更广泛的耐药病原体进行测试.
