在苏格兰和新加坡队伍中,基于DNA甲基化的代谢特征预测器
Hannah M Smith1, Hong Kiat Ng2, Joanna E Moodie3
1Centre for Genomic and Experimental Medicine, Institute of Genetics and Cancer, University of Edinburgh, Edinburgh, UK.
American journal of human genetics
|December 20, 2024
概括
像BMI这样的代谢特征的表观遗传分数 (EpiScores) 在人口中广泛适用. 这些基于DNA甲基化的得分可以预测代谢健康,并与认知功能相关联,提供客观测量潜力.
科学领域:
- 遗传学和表观遗传学
- 代谢健康研究 代谢健康研究
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 代谢健康特征与潜在的生物过程有共同之处.
- DNA甲基化 (DNAm) 提供了对新陈代谢健康的分子见解.
- 表观遗传分数 (EpiScores) 可以作为复杂特征的客观分子代理.
研究的目的:
- 通过DNA甲基化来探索代谢健康的分子相关性.
- 开发和验证六个关键代谢特征的EpiScores.
- 评估代谢EpiScores的跨种群适用性和生物学关联.
主要方法:
- 全表观基因组关联研究 (EWAS) 对来自苏格兰世代 (GS) 队列的> 17,000 名个人进行.
- 训练EpiScores的身体质量指数 (BMI),身体脂肪百分比,腰部和部的比例,葡萄糖,高密度胆固醇和总胆固醇.
- 在独立的苏格兰 (LBC1936) 和新加坡 (HELIOS) 队列中验证EpiScores,包括子组分析和与认知功能的相关性.
主要成果:
- 一个联合和有条件的贝叶斯惩罚回归确定了27个高信心的BMI关联,与边际的EWAS发现形成鲜明对比.
- 训练有素的EpiScores证明了广泛的适用性,在苏格兰和新加坡队伍中表现良好.
- EpiScores解释了代谢特征的显著差异 (例如,HELIOS中的BMI高达20.8%) 并显示了人群特异性差异 (例如,HELIOS子组中的身体脂肪).
- 代谢性EpiScores与LBC1936队列中的认知功能相关 (pFDR <0.05).
结论:
- 对甲基组相关性结构的考虑对EWAS的发现产生了重大影响.
- 代谢特征EpiScores在各种人群中广泛适用.
- EpiScores提供了对代谢健康的客观测量,并与认知功能相关联,突出了它们在生物医学研究中的实用性.
