意大利养猪场中PRRS病毒的进化动态:一项回顾性研究
Giovanni Parisio1, Giovanni Franzo2, Ilaria Barbieri3
1Istituto Zooprofilattico Sperimentale della Lombardia e dell'Emilia Romagna, Brescia, 25124, Italy. giovanni.parisio@izsler.it.
Virology journal
|December 20, 2024
概括
猪生殖和呼吸系统综合征 (PRRS) 是一种昂贵的猪病. 对PRRSV ORF7序列的贝叶斯分析揭示了2000年代意大利的人口繁荣,起源于埃米利亚-罗马尼亚.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 人口遗传学 人口遗传学
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 猪生殖和呼吸系统综合征 (PRRS) 对养猪业构成重大全球经济威胁.
- 目前的疫苗对PRRS病毒 (PRRSV) 提供有限的保护,因为它具有很高的遗传变异性.
- 加强生物安全和农业实践对于PRRSV制至关重要.
研究的目的:
- 使用15年的ORF7序列数据集推断意大利PRRSV的种群动态.
- 估计PRRSV菌株最近的共同祖先 (TMRCA) 的进化速率和时间.
- 确定意大利PRRSV的地理来源和植物地理.
主要方法:
- 对PRRSV ORF7序列的数据集进行了贝叶斯系遗传学和植物地理学分析.
- 使用随机数据子集来优化计算运行时间.
- 使用基于凝聚的方法估计了进化速率和TMRCA.
主要成果:
- 预计PRRSV的进化速度与其他RNA病毒 (4-7 × 10-3替代/地点/年) 一致.
- 意大利的PRRSV种群规模从2000年代初到2010年左右大幅增加,随后出现异质动态.
- 据推断,PRRSV的地理来源是埃米利亚-罗马尼亚地区,尽管伦巴第拥有更大的养猪业务.
结论:
- 遗传学和遗传地理分析是了解PRRSV种群动态的宝贵工具.
- 推断出的人口动态表明,农场管理和生物安全选择显著影响疾病传播.
- 了解病毒演变和传播模式对于有效的PRRSV控制策略至关重要.
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