命名实体认可用于消除西班牙电子健康记录的识别
Francisco J Moreno-Barea1, Guillermo López-García2, Héctor Mesa1
1Departamento de Lenguajes y Ciencias de la Computación, Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Universidad de Málaga, Málaga, Spain.
Computers in biology and medicine
|December 22, 2024
概括
这项研究表明,变压器模型有效地消除了西班牙电子健康记录 (EHR) 的身份,超过了RNN. 此外,还提供了一个网络应用程序,以帮助临床医生完成这一关键的数据保护任务.
科学领域:
- 自然语言处理自然语言处理.
- 机器学习 机器学习
- 医疗信息学 医疗信息学
背景情况:
- 电子健康记录 (EHR) 对临床决策有价值,但需要对数据共享进行非识别.
- 之前关于电子病历删除身份的研究主要使用英语数据,因为西班牙人的资源有限.
- 对于更广泛的数据传播和研究来说,西班牙电子健康记录的自动去识别是必不可少的.
研究的目的:
- 在西班牙语中探索医疗文件的自动非识别.
- 为此任务开发和比较深度学习模型.
- 为了创建一个实用的工具,去识别西班牙临床笔记.
主要方法:
- 599个西班牙临床病例的私人数据库被注释为受保护的健康信息.
- 命名实体识别 (NER) 被用作核心预测任务.
- 实施了两种深度学习方法:循环神经网络 (RNN) 和变压器 (特别是XLM-RoBERTa).
- 使用文本扩展程序来增强训练数据.
主要成果:
- 变压器模型在取消西班牙临床数据的识别方面明显优于RNN.
- 在扩展的机体上,XLM-RoBERTa变压器实现了高性能指标 (精度:0.946,回忆:0.954,F1:0.95).
- 开发了一个功能性的Web应用程序,以协助临床医生在EHR中解除身份.
结论:
- 最先进的变压器模型实际上适用于精确的西班牙临床笔记的非识别.
- 这些模型可以提高EHR在现实世界医疗环境中的实用性.
- 通过持续的预训练策略,可以实现进一步的绩效改进.
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