基于年龄组的肠道微生物组和代谢组图书馆构建,使用韩国传统犬种Sapsaree的短读和长读测序技术
Seon-Hui Son1, Min-Geun Kang1, Anna Kang1
1Department of Agricultural Biotechnology and Research Institute of Agriculture and Life Science, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea.
Frontiers in microbiology
|December 23, 2024
概括
高龄狗表现出肠道微生物群的转变,有较少的有益细菌和更多的致病性类型. 年龄会影响肠道细菌和代谢物概况,这表明需要进一步进行狗肠道健康研究.
科学领域:
- 兽医科学 兽医科学 兽医科学
- 微生物学 微生物学
- 代谢学 代谢学 代谢学
背景情况:
- 肠道微生物群对宿主健康起着至关重要的作用.
- 肠道微生物群的与年龄相关的变化在各个物种中都被观察到.
- 了解像狗这样的伴侣动物的这些变化对于他们的福祉很重要.
研究的目的:
- 为了研究Sapsaree犬的肠道微生物群和新陈代谢的与年龄相关的变化.
- 为了比较Illumina和Nanopore测序对狗肠道微生物组分析的有效性.
- 为了探索肠道微生物组成和老年狗中的代谢物概况之间的相关性.
主要方法:
- 使用Illumina (短读) 和Nanopore (长读) 测序进行元基因组学分析.
- 代谢分析,以分析犬类样本中的小分子.
- 对不同年龄组的细菌属和代谢物概况进行比较分析.
主要成果:
- 坚固菌是占主导地位的细菌类.
- 有益的细菌属下降,而致病性属在老犬中增加.
- 代谢分析揭示了不同年龄组特定的代谢物,与微生物变化相关.
结论:
- 年龄显著影响Sapsaree犬的肠道微生物群组成和代谢概况.
- 无论是Illumina还是Nanopore测序,都提供了对狗肠道微生物组有价值的,尽管是不同的见解.
- 需要进一步的研究来阐明狗的衰老,肠道微生物群和代谢之间的复杂相互作用.
